Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd163Q2VLH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd163Q2VLH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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