Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trpm1Q2TV84 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trpm1Q2TV84 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpm1Q2TV84 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms