Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cers3Q1A3B0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cers3Q1A3B0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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