Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf3ip1Q149C2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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