Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VgfQ0VGU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VgfQ0VGU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms