Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hif3aQ0VBL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hif3aQ0VBL6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms