Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcnt1Q09324 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcnt1Q09324 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms