Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cass4Q08EC4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms