Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssrp1Q08943 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssrp1Q08943 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssrp1Q08943 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms