Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata4Q08369 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata4Q08369 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms