Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Calb2Q08331 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb2Q08331 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb2Q08331 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms