Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F13bQ07968 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F13bQ07968 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms