Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ebf1Q07802 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ebf1Q07802 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ebf1Q07802 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms