Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Col9a2Q07643 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms