Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cdx4Q07424 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cdx4Q07424 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cdx4Q07424 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdx4Q07424 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cdx4Q07424 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cdx4Q07424 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cdx4Q07424 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cdx4Q07424 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdx4Q07424 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cdx4Q07424 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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