Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cntn3Q07409 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cntn3Q07409 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms