Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nfe2Q07279 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nfe2Q07279 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nfe2Q07279 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms