Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp2Q06649 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp2Q06649 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms