Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrx2Q06348 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrx2Q06348 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrx2Q06348 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms