Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Thbs3Q05895 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Thbs3Q05895 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms