Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox10Q04888 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox10Q04888 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms