Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RelaQ04207 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms