Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nucb1Q02819 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nucb1Q02819 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms