Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GscQ02591 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GscQ02591 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GscQ02591 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GscQ02591 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GscQ02591 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GscQ02591 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GscQ02591 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GscQ02591 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GscQ02591 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GscQ02591 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GscQ02591 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GscQ02591 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms