Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp39Q02525 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp39Q02525 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms