Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Htr1fQ02284 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms