Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snai1Q02085 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snai1Q02085 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms