Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ascl1Q02067 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms