Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ly9Q01965 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ly9Q01965 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ly9Q01965 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ly9Q01965 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ly9Q01965 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms