Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VcpQ01853 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VcpQ01853 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VcpQ01853 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms