Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd1Q01822 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms