Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Top2aQ01320 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Top2aQ01320 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms