Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pde1bQ01065 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde1bQ01065 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms