Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbp1Q00915 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rbp1Q00915 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms