Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VegfaQ00731 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VegfaQ00731 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms