Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb4P99026 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb4P99026 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb4P99026 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms