Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc35b1P97858 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc35b1P97858 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms