Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AlkP97793 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AlkP97793 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AlkP97793 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AlkP97793 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AlkP97793 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AlkP97793 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AlkP97793 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AlkP97793 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AlkP97793 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AlkP97793 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlkP97793 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlkP97793 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlkP97793 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlkP97793 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AlkP97793 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AlkP97793 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AlkP97793 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AlkP97793 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms