Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarcc1P97496 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1P97496 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarcc1P97496 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms