Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Smyd1P97443 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smyd1P97443 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms