Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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SmsP97355 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SmsP97355 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SmsP97355 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SmsP97355 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SmsP97355 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SmsP97355 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmsP97355 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SmsP97355 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmsP97355 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmsP97355 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmsP97355 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SmsP97355 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SmsP97355 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SmsP97355 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmsP97355 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SmsP97355 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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SmsP97355 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SmsP97355 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SmsP97355 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SmsP97355 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SmsP97355 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SmsP97355 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms