Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otx2P80206 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otx2P80206 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms