Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ctps1P70698 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctps1P70698 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctps1P70698 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms