Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tgif1P70284 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tgif1P70284 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms