Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfixP70257 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfixP70257 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfixP70257 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfixP70257 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfixP70257 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfixP70257 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfixP70257 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfixP70257 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfixP70257 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfixP70257 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfixP70257 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfixP70257 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfixP70257 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfixP70257 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfixP70257 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfixP70257 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfixP70257 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfixP70257 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfixP70257 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfixP70257 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfixP70257 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfixP70257 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms