Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chl1P70232 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chl1P70232 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chl1P70232 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chl1P70232 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chl1P70232 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms