Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd13P70217 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms