Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrig1P70193 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrig1P70193 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms