Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpnP63163 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms