Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrx1P63013 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrx1P63013 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms